分类

其它行业

RNAdraw(RNA二级结构分析软件)

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

大小:548 KB

语言:简体中文系统:WinXP, Win7, Win8, Win10, WinAll

类别:其它行业时间:2018-07-11

  在生物学中,分析RAN是经常做的实验,其分析方式和DNA类似,可以检查生物细胞结构,当您需要分析二级结构的时候,可以选择这款软件帮助您建立分析环境,提供多种生物数据格式导入,将分析的RNA数据加载到软件就可以建立二级序列,通过图形的方式分析RNA结构依旧分子结果,并且显示碱基内容;RNAdraw(RNA二级结构分析软件)使用比较简单,小编提供了英文版本和中文版本,方便不同语言习惯的朋友使用!

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

软件功能

  让您知道核糖苷酸的分裂情况,通过软件分析实验结果

  兼容多个数据导入,从不同的生物数据加载

  对分析病毒的核糖苷酸也是有作用的

  也让您在分析细胞的时候获得二级序列图

  RNA主要在细胞里面生存

  在进行细胞学实验的时候分析RNA是最普遍的实验

  您可以将生物数据添加到rnadraw建立分析

  提示碱基内容,提示核酸内容

  核酸的字体也是可以在软件选择的

软件特色

  - DOS/UNIX文本文件可以导入到序列编辑窗口和序列信息编辑窗口。

  - GenBank查找的结果文件可以导入到RNAdraw. 不同的组成内容会被放到相应字段中去。

  - RNAfold结构计算输出文件可以当成新文件导入,也可以与现存的文件合并。这样就可以利用UNIX 强大的计算功能来计算,然后用RNAdraw来处理结果。

  - Mfold关联Connect (.ct,.con ( GCG PlotFold -H ))文件可以当成新文件导入,也可以与现存的文件合并。这样就可以用M. Zukers不同版本的mfold程序来计算最佳的结构然后用RNAdraw来处理结果。

使用方法

  1、将汉化版安装就可以启动,提示安装地址c:program filesbiochemsoftrnadraw

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  2、这里是软件的启动界面,您需要打开RNA文件

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  3、Rnafold输出文件、Mfold连接文件(.ct.con),

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  4、一级顺序来源、空白、导入文本文件、从剪贴板粘贴、GenBank查找结果

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  5、辅助信息来源、空白、导入Ms-Dos文本文、导入Unix文本文件、从剪贴板粘贴

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  6、新建以后您的RNA内容就在这里编辑,显示一级序列、碱基信息

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  7、点击这里提示一个定制RNA文库的功能,在这里显示RAN的数据

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

  8、提示能量设置,在这里编辑碱基内容,编辑内部碱基结构

RNAdraw(RNA二级结构分析软件) 1.1b2 绿色汉化版

主要优势

  堆积碱基对在37度的焓(0.1cal/Kmol)NST=非标配对碱基对)

  37度多元环对结构的能量贡献0.01* kcal/mol

  NST=非标配对之碱基对

  多元环对能里贡献大致按以下方法计算:

  E=末端碱基对+中间碱基对*k+非配对碱基*u

  u=多元环中没配对的碱基数

  k=从多元环中形成的螺旋数

  5摆动末端对结构能里的贡献(在37度)0.01 "kcal/moll)

参数设置

  常规选项:启动时最大化

  保存2D坐标窗口

  自动展开结构条目

  使用 RNAdraw光标显示数据清单标记

  厂成功计算提示

  内存不足警告

  计算失败提示

∨ 展开

网友评论

我要跟帖
取消
所有评论 共 0