Turbomole 2016是一款量子化学分析软件,在高级化学分析中,通过实验分析数据明显的速度比较慢,得出的结果也会比较有限的,利用计算机技术辅助分析就可以帮助您完成多种学习元素的分析,您可以在软件中创建量子化学模型,结合实验得出的数据,利用其虚拟的实验技术,可以让您在COSMOlogic TURBOMOLE 中完成大量复杂的化学计算,本软件具有高效的计算逻辑,无论是有机化学还是生物化学,都可以在本软件中完成实验分析,需要的朋友可以下载试试!
软件功能
量子化学
Turbomole是一个功能强大的通用量子化学程序包为特色的国家的最先进的电子结构方法。它涵盖了广泛的学术界和工业界的研究领域。结合25年多的发展,已经成为一个标准的封装和Turbomole化学家的一个有价值的工具,物理学家和工程师
Turbomole快速和强大的量子化学
对于世界范围内的研究人员来说,量子化学计算是必不可少的。在Turbomole我们提供一个强大的、通用的量子化学(QC)从头电子结构的计算程序包。
Turbomole可以帮助你优化和化学反应提供最佳的催化剂,理解和提高有机发光二极管(OLED)或预测光谱作为一种通用的辅助化合物的合成和分析的任务。它允许准确预测的属性,如构象能,簇结构,激发态,过渡态和偶极子,你可以使用在各种各样的应用。
Turbomole数据库是高质量的预先计算的复合信息的COSMO-RS计算需要的集合。他们包括在量子化学水平支持COSMOtherm数据库。每个化合物是由一套宇宙代表(σ表面信息)和能量(气相能量)文件和物理复合数据的附加文件。只需添加到您的cosmothermx数据库设置和使用的化合物为你的研究里面的图形用户界面
cosmobase
cosmobase是宇宙的旗舰数据库。它几乎包括了所有常见的溶剂,包括小分子大而复杂的物质,与各种官能团覆盖物质类(如烃类,醇类、醚类、羰基化合物、酸、酯、胺、酰胺、硝基化合物、杂环化合物、卤代化合物,和更多)。
cosmobaseil
发现离子液体的世界。
cosmobaseil是一个典型的离子液体的阳离子和阴离子。目前的数据库包含421个阳离子和109个阴离子,可以独立组合,形成一组巨大的潜在离子液体。
cosmobaseff
作为一种特殊用途的数据库包含超过2000的cosmobaseff香精香料。的cosmobaseff是理想的附加消费品或香水公司。
软件特色
离子和中性分子:中性和带电物种的极化电荷密度是在相同的范围内,它允许在相同的模型中包含不同电荷态的化合物。
logki和LSP的线性关系:LSP构成一个最适合的PKI值的线性回归分析的参数设置,根据研究范式。cosmosar3d提供理论基础,logki值应该是LSP的描述符的线性函数。据我们所知,目前还没有其他的分子领域使用MFA可以要求这样一个健全的理论理由的期望的线性PKI模型。
采用最先进的量子化学方法如TDDFT,耦合簇,MP2,DFT,Hartree Fock,…
Turbomole已经发展到治疗分子的工业应用提供一个快速和稳定的代码。随着ri-dft的tubromole实施,最快的DFT方法将在您的指尖。
从全平台灵活性获利。Turbomole支持Linux,一些Unix系统,Windows,和MacOS在串行和并行模式。
安装方法
1、下载解压文件,找到TmoleX42_Win64_DEMO.exe,双击进入欢迎界面,点击下一步
2、按照系统提示,单击“下一步”按钮,如图所示。请详细阅读本协议,认可后请点击“是”按钮进行下一步操作。
3、如图所示,系统默认的安装路径是C:Program FilesCOSMOlogicTmoleX16 ,如果想改变安装路径,请使用鼠标单击“浏览”按钮(建议选用默认路径)
4、设置好所需安装内容后,单击“下一步”按钮,弹出设置程序文件夹操作界面。系统默认的程序文件夹是“abcAVI Tag Editor”在一般情况下不需要做任何修改。
5、单击“下一步”按钮,系统将对软件自动进行安装。由于用户安装选项不同,所以安装时间也不同。直到出现安装完成则表示系统安装完毕。
6、出现这个界面就说明安装成功了,在桌面打开软件就能使用了
使用方法
cosmosar3d
作为一种替代方法,以相似性为基础的配体评价,QSAR模型用于关联的分子和它们的生物活性的计算属性。cosmosar3d是cosmosim3d采用定向配体的LSP作为一种新型的三维定量构效关系分子相互作用场的一个扩展集。
探针分子在网格中随机旋转和翻译。对于每个位置,3D相似度计算。与模板和探针分子之间的最大的3D相似性的位置被用于对齐。
从cosmosim3d对齐得到叠加八配体及其宇宙空洞。分子和腔呈现PyMOL。
连续介质模型(CSMS)如PCM或宇宙广泛应用于量子化学近似的溶剂效应。在这里找到一个阵容的影响在溶液和COSMO-RS和CSMS将它们的能力。
基态化学
最先进的应用在Turbomole允许使用DFT的高效实现化学的所有领域,MP2和耦合簇方法。自旋轨道耦合效应和近年来的发展,如DFT +分散或明确相关F12方法可用于高精度的应用。
Turbomole和COSMOtherm
生成该文件作为Turbomole COSMOtherm处理溶液热力学的输入。几个快捷键和调整确保最佳和cosmoconf Turbomole COSMOtherm合作,以最小的努力来获得最好的结果。
此外,COSMOtherm是将量子化学解决方案的理想选择。通过提供溶剂化的自由能,化学反应可以从量子化学气相状态转移到所需的流体相。
使用说明
基准
Turbomole开创了量子化学方法的发展准确模型的可接受的计算成本,实际生活中的应用。
一个最重要的模块并行MPI版本实现了在上世纪90年代中期在IBM RS6000集群。极其高效的串行代码并行化获得有限数量的一个合理的加速处理器,并扩展到运行在一个大规模并行系统以后。
一个简单的使用新的并行SMP和多核系统是最近几年发展起来的,这使得低运行时间的典型和廉价的标准个人电脑以及数以百计的高性能CPU NUMA系统。
周期系统的DFT计算(新模块:成熟)
成熟是一种基态能量计算模块分子和周期性系统在ri-dft水平[ 1 ]
低比例MP2和MP2-F12(新模块:pnoccsd)
pnoccsd程序包含对自然轨道基础
大系统缩放。(目前仅限于MP2)[2,3]
CCS两部分,ADC(2),独联体(INF),和CC2的激发能量和ADC的兴奋状态发生变化的时刻(2)和CC2(RICC2)[ 4 ]
自我定义和几个预定义的密度泛函(RIDFT,rdgrad,,aoforce,ESCF)
反应路径优化(新模块:woelfling)优化开始与一个线性同步转变(LST)后跟一个链的状态的方法,优化了反应路径的唯一约束下等距的结构。相反,弹性带或长字符串的方法,它不需要弹簧力,插值算法,或者其他的启发式控制结构分布
系统要求
Turbomole优化运行的箱体在多种硬件平台上运行Linux,Windows,苹果的Mac OS X系统,IBM、SGI和Cray Unix / Linux机器,通常可在超级计算机中心。
在一般情况下,我们建议机器至少有1 GB的内存,每个核心和一些十GB的免费磁盘空间。64bit硬件和操作系统是强制性的。所有版本的Turbomole包括并行版本,但强烈要求使用或时间并行作业Linux是高度推荐。
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